Ledynmečiu, maždaug prieš 25 000 metų, nusileido ledynas, sukūręs Valdų aukštumą su kalvomis. Gautos duobės pradėjo užpildyti tirpiu vandeniu, ir gimė garsusis Seligero ežeras. Ežeras turi skaidrų vandenį, kuris atitinka jo pavadinimą, kuris išvertus iš suomių kalbos „selhea“reiškia „švarus, skaidrus“.
Ežeras taip pat stebina jame esančių salų skaičiumi, kurių yra apie 169 vienetai. Daugelis jų nėra tokio didelio ploto (apie 10 metrų skersmens), tačiau didžiausia yra Khachino sala, kurioje yra 13 nedidelių savo ežerų.
Ne mažiau nuostabi ir graži legenda buvo suformuota apie nuostabų Seligero ežerą su savo salų įvairove. Legenda pasakoja, kad labai senovėje broliai-ežerai Ilmenas ir Seligeris gyveno žemėje. Broliai turėjo Volgos seserį, kurią labai mylėjo. Ir kažkaip Volga paprašė parodyti jai Kaspijos jūrą, apie kurios didybę ji buvo girdėjusi. Broliai negalėjo jos atsisakyti ir pažadėjo išpildyti norą. Jie susirinko į žygį, tačiau sutiko eiti visi kartu ir tik dienos metu, kad nepasimestų ir nepasimestų. Taip ir padaryta, jie tęsėsi kelias dienas. Tačiau vieną naktį Ilmeno brolis pabudo ir pamatė, kad Seligerio brolis jį apgavo ir slapta išvyko su seserimi. Brolis Ilmenas supyko dėl tokios išdavystės ir prakeikė jį už klastą šiais žodžiais: „O brolis Seligeris, kuris mane išdavė, aš prakeikiu tave už tavo neištikimybę! Taigi tebūna šimtas kuprų ant nugaros! Dievai jį išgirdo ir už tai, kad Seligeris sulaužė priesaiką, jie įvykdė jo brolio prakeikimą. Nuo tada Seligeris dėvėjo tokį skaičių kuprų salų.
Šiandien ežero pakrantė yra 590 kilometrų. Vandens plotas yra 260 kvadratinių kilometrų. Seligeris turi didelius ir mažus ruožus, kuriuos jungia sąsiauriai. Plyos yra palyginti didelis vandens telkinys, esantis tarp salų.
Ežeras taip pat turi sąsiaurius, siaurieji vadinami tarpiniais, didieji - upėmis. Bendras išsiliejimų skaičius yra 23. Ežeras turi smėlio dugną. Dėl daugybės seklumų, esančių ežere, juo plaukioti gali tik mažos valtys, tačiau yra didelė įduba, kurios gylis siekia 30 metrų.
Pats ežeras ir aplinkiniai peizažai alsuoja kerinčiu grožiu, todėl šią vietą verta aplankyti.
